Вирус Коксаки относится к семейству энтеровирусов. Такое название они получили из-за того, что размножаются преимущественно в желудочно-кишечном тракте. Однако воспаление в органах пищеварительной системы энтеровирусы вызывают редко — как правило, они перемещаются по организму с кровью и инфицируют другие органы.